Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc50Q810U5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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