Protein–RNA interactions for Protein: Q80W14

Prpf40b, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf40bQ80W14 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prpf40bQ80W14 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prpf40bQ80W14 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prpf40bQ80W14 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Prpf40bQ80W14 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf40bQ80W14 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf40bQ80W14 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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