Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cfap100Q80VN0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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