Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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