Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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