Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn4bQ7M729 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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