Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ScocQ78YZ6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms