Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rph3alQ768S4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rph3alQ768S4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms