Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nme8Q715T0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms