Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssxb3Q6XAS4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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