Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trak1Q6PD31 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms