Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NipblQ6KCD5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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