Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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