Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cntn4Q69Z26 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cntn4Q69Z26 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms