Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pkp4Q68FH0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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