Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Sbno1Q689Z5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sbno1Q689Z5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms