Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sdc3Q64519 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sdc3Q64519 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms