Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Ccdc18Q640L5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc18Q640L5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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Ccdc18Q640L5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Ccdc18Q640L5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Ccdc18Q640L5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc18Q640L5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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