Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Rbbp7Q60973 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rbbp7Q60973 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rbbp7Q60973 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms