Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CttnQ60598 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms