Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tsr1Q5SWD9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tsr1Q5SWD9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Tsr1Q5SWD9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Tsr1Q5SWD9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Tsr1Q5SWD9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms