Protein–RNA interactions for Protein: Q45HK4

Sh2d1b2, SH2 domain-containing protein 1B2, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1b2Q45HK4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh2d1b2Q45HK4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms