Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfdn4Q3UWL8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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