Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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D130052B06RikQ3UW13 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
D130052B06RikQ3UW13 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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