Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm29609Q3UU56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms