Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sf3b2Q3UJB0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sf3b2Q3UJB0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms