Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trafd1Q3UDK1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms