Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Rnf149Q3U2C5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rnf149Q3U2C5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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