Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc174Q3U155 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms