Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnpla6Q3TRM4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms