Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc10Q3TLI0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms