Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Fam107bQ3TGF2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Fam107bQ3TGF2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms