Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rtl9Q32KG4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl9Q32KG4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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