Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col24a1Q30D77 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Col24a1Q30D77 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms