Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cpne9Q1RLL3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cpne9Q1RLL3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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