Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

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Length 1,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Col19a1Q0VF58 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Col19a1Q0VF58 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Col19a1Q0VF58 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Col19a1Q0VF58 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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