Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp2b3Q0VF55 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms