Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zc3h18Q0P678 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zc3h18Q0P678 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms