Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vps8Q0P5W1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms