Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Neurl1bQ0MW30 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms