Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnma1Q08460 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms