Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
AmbpQ07456 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms