Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms