Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Sox8Q04886 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Sox8Q04886 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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