Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tff2Q03404 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tff2Q03404 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms