Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NfiaQ02780 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms