Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms