Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pde1bQ01065 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms