Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Serpina1cQ00896 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms