Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rbp4Q00724 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms